南京梅山医院胸外科创立于1971年，由上海中山医院、华山医院等多家医院的专家共同组建，经过40余年的建设，已经发展成为一个具有一定技术力量的独立科室。目前有主任医师1名，副主任医师1名，主治医师2名，住院医师2名；医学硕士研究生1名；所有医师均具有本科以上学历；拥有具有中、高级职称的护师10余名。骨干医师都曾在复旦大学附属上海中山医院、及南京等多家知名医院进修、学习，与江苏省人民医院、江苏省肿瘤医院、南京鼓楼医院、南京胸科医院等有协作关系。先后在国内省级以上杂志上发表各类论文数十篇。并拥有设备齐全、业务能力全面的专科ICU，为胸外科手术及创伤病人提供全面支持，确保病人安全。胸外科以高起点、高标准、高规格为建科宗旨，以崇高的医德、精湛的医术、热忱的态度服务病人。
拥有设备：胸腔镜、纤支镜、肿瘤射频消融仪、超声刀、心电监护仪、无创呼吸机、高流量吸氧仪、便携式脉氧仪、静脉输液泵、肠内营养泵、体外振动排痰仪、亚低温治疗仪。
目前南京梅山医院胸外科每周一下午，周二、周三、周五上午设有胸外科专科门诊，每周四上午开设肺部结节多专科专家门诊（MDT）。每年门诊量2000余人次，诊治的病种包括肺部良、恶性肿瘤；食管癌、贲门癌及食管疾病；纵隔肿瘤；胸部创伤；胸壁及胸膜疾病；支气管扩张；脓胸、肺大泡、肺脓疡、肺囊肿、肺气肿；膈肌疾病等。年住院病人超过300例，完成各类手术近百台。能开展各种类型的胸外科常规及微创手术，均取得良好的疗效。在长期的临床工作中，已形成了梅山胸外疾病的诊治特色。